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NEURON (NEURONA)

NEURON es un entorno de simulación para desarrollar y ejercitar modelos de neuronas y redes de neuronas. En particular es bastante apropiado para los problemas donde las propiedades de envío de las células juegan un papel importante, incluyendo posiblemente el potencial extracelular cercano a la membrana, y donde las propiedades de la membrana celular son complejas, involucrando muchos canales de iones específicos, la acumulación de iones y los segundos mensajeros. Evoluciona a partir de la amplia colaboración entre Michael Hines en el Departamento de Ciencias Computarizadas, Escuela de Medicina de la Universidad de Yale y John W. Moore en el Departamento de Neurobiología en el Centro Médico de la Universidad de Duke. Su meta expresa era crear una herramienta diseñada específicamente para resolver las ecuaciones que describen a las células nerviosas. NEURON le permite a los usuarios enfocarse en las características anatómicas y biofísicas importantes del modelo, sin distraerse por las cuestiones computarizadas como el tamaño del compartimiento. Cumple esta función en parte a través de la noción de “secciones” continuas de cable que están conectadas juntas para formar cualquier clase de arquitectura bifurcada y que están dotadas con propiedades que pueden variar continuamente con la posición a lo largo de la sección. Las propiedades de la membrana y el citoplasma definidas por el usuario se expresan en términos de esquemas cinéticos y juegos de ecuaciones simultáneas. Los estados y el voltaje de la membrana se calculan eficientemente compilando estas descripciones del modelo y utilizando un método de integración implícita optimizado para estructuras bifurcadas. Se puede elegir la integración de orden variable y de medida variable para alcanzar una exactitud y/o velocidad incrementada. NEURON hace realidad un grado increíble de flexibilidad utilizando un intérprete orientado al objeto para establecer las propiedades anatómicas y biofísicas del modelo, definir la aparición de la interfase gráfica, controlar las simulaciones y trazar los resultados. Dos adiciones recientes a la interfase gráfica del usuario merecen una mención especial: "CellBuilder" permite a los usuarios crear modelos nuevos de modelos existentes descartados y modificados sin escribir ningún código; y “Multiple Run Fitter” facilita en gran medida, la optimización de los modelos que tienen espacios de parámetros altamente dimensionales. 

Medio: Descargable de: http://www.neuron.yale.edu/neuron/install/install.html
Requerimientos del sistema: Desarrollado en un inicio en el entorno UNIX/Linux, NEURON posteriormente fue cargado a Windows (todas las versiones) y Mac OS. Es el único simulador neural que funciona en todas las plataformas comunes de hardware, desde microcomputadoras por debajo de US$1,000 hasta súper computadoras, trayendo consigo la capacidad de realizar simulaciones de calidad de investigación al alcance de los neurocientíficos alrededor del mundo.
Precio: Freeware